Introduction à l’analyse de survie, courbe de Kaplan-Meier

Dans ce cours, nous abordons le domaine particulier des statistiques qui est l’analyse de survie. Dans cette première vidéo nous allons apprendre les notions de base, notamment, la fonction de survie et l’estimateur de survie de Kaplan-Meier. Quand on fait l’analyse de survie, on cherche habituellement à modéliser la survie, c’est-à-dire, le temps restant avant la mort, des organismes biologiques. Cette analyse est utilisée en médecine, mais pas uniquement. L’analyse de survie s’applique également à d’autres domaines, ainsi qu’à des systèmes artificiels, par exemple, pour modéliser le temps restant avant une panne d’un appareil. Dans ce cours, nous utilisons des exemples de jeux de données de cancers, en biologie et médecine. Dans ce contexte, nous appliquons l’analyse de survie à la survie des patients. Le cours présente tout d’abord la fonction de survie qui est une notion fondamentale dans ce domaine. Elle représente la probabilité qu’un évènement (par exemple, le décès d’un patient atteint d’un cancer) arrive après un certain temps. La fonction de survie prédit le pronostic pour chaque patient. C’est une information importante pour le médecin qui l’aide à choisir un traitement adapté. La deuxième partie du cours est consacré à l’estimateur de Kaplan-Meier qui permet d’approximer la fonction de survie théorique à partir d’un jeu de données. Vous pouvez suivre une démonstration pas à pas de la construction d’une courbe de Kaplan Meier dans le cas de données non censurée et ensuite dans le cas de données censurées. A la fin du cours, on analyse un exemple d’une courbe de survie pour les données réelles du cancer du sein. Intervenant : Ekaterina Flin, ingénieur en informatique, groupe EpiMed, Institut pour l’Avancée des Biosciences (IAB), Université Grenoble Alpes (UGA) #analyse_de_survie #kaplan_meier Table des matières 00:00 Introduction à l’analyse de survie 00:44 Notion de la fonction de survie 02:11 Exemple : espérance de vie d’un être humain 03:17 Estimation de survie avec la courbe de Kaplan-Meier 04:49 Démonstration : courbe de Kaplan-Meier pour les données non censurées 05:33 Notion des données censurées 06:46 Démonstration : courbe de Kaplan-Meier pour les données censurées 08:13 Exemple : courbe de survie pour les données réelles du cancer du sein 09:08 Intervalle de confiance et survie médiane 09:39 Bilan du cours et points clés à retenir 10:12 Annonce des prochains cours et conclusion Liens Créer une courbe de survie de Kaplan-Meier avec Python :    • Créer une courbe de survie de Kaplan-Meier...   Le test du logrank pour comparer des courbes de survie :    • Le test du logrank pour comparer des courb...   Introduction au modèle à risque proportionnel de Cox :    • Introduction au modèle à risque proportion...   Applications du modèle à risque proportionnel de Cox :    • Applications du modèle à risque proportion...